Ο Εθνικός Πειραιά ιδρύθηκε το 1923. Η πρώτη επιτυχία του συλλόγου ήταν η κατάκτηση του Κυπέλλου Ελλάδας το 1933. Από το 1940 μέχρι το 1978 η ομάδα είχα μία σταθερή πορεία μιας και τερμάτιζε πάντα σε μία καλή βαθμολογική θέση στην Α’ Εθνική. Από το 1980 και ύστερα η ομάδα από τον Πειραιά ξεκίνησε να έχει προβλήματα κυρίως οικονομικά. Το 1991 αγωνίζεται για πρώτη φορά στην ιστορία του στην Β΄ Εθνική και μέχρι το 2000 βρίσκονταν συνεχώς μεταξύ Α’ και Β’ Εθνικής. Την τριετία 2000 – 2003 αγωνίστηκε στη Γ' Εθνική. Στο τέλος της περιόδου 2002 – 2003 πάρθηκε μία πολλή σημαντική και δύσκολη απόφαση, ο σύλλογος λόγω αδυναμίας να ανταπεξέλθει στις οικονομικές του υποχρεώσεις από την επόμενη σεζόν θα αγωνιζόταν στη Δ’ Εθνική, και μετά από μια περιπέτεια στα τοπικά Πειραιά, επέστρεψε στη Γ’ Εθνική.